Wielkie wirusy i bakterie czają się w glebie
Gleba kryje gigantyczne wirusy i bakterie, które dotychczas z nią nie kojarzyły się. Foto_Arkadiusz Artyszak
Ogromne wirusy, a także wiele bakterii niekojarzonych dotąd z glebą, odkryli niespodziewanie naukowcy prowadzący badania wpływu globalnego ocieplenia na glebę - informuje pismo "Nature Communications".
Zasadniczym celem długoletnich badań prowadzonych przez doktora Jeffreya Blancharda i zespół naukowców z University of Massachuetts w Amherst oraz DOE Joint Genome Institute jest obserwacja wywołanych przez globalne ocieplenie zmian dotyczących glebowych mikroorganizmów.
Wpływ uprawy roli na drobnoustroje glebowe
Drobnoustroje glebowe współtworzą środowisko wzrostu i rozwoju roślin. Często uważane są za najważniejszy czynnik w kształtowaniu jakości gleby oraz wielkości plonów. Odpowiedzialne są m. in. za przeprowadzanie procesów...
Za pomocą specjalnych kabli grzewczych zakopanych 10 centymetrów pod powierzchnią gleba podgrzewana jest do temperatury o 5 stopni Celsjusza wyższej niż otoczenie, co symuluje ocieplenie klimatu.
Przy okazji badań w próbkach gleby z lasu Harvard Forest w Petersham (Massachusetts) odkryto wiele bakterii niekojarzonych dotąd z glebą oraz 16 wielkich DNA - wirusów.
Prawdopodobnie występuje tam kilkakrotnie więcej gatunków wirusów.
Odkrycie jest tym bardziej niespodziewane, że większość opisanych wcześniej wirusów o wyjątkowo dużych rozmiarach występowała w środowisku wodnym.
Nowe wirusy i nietypowe bakterie udało się odkryć dzięki nowatorskiemu, mini-metagenomicznemu podejściu (metagenomika to badanie genomów populacji drobnoustrojów). Pozwala ono badać mikroorganizmy szybko i tanio.
Mikroorganizmy glebowe - niewielkie, a jakże ważne
Przyjmuje się, że każdy gram gleby może zawierać setki milionów, a nawet miliardy przedstawicieli różnych grup drobnoustrojów. Bakterie, grzyby i promieniowce to najważniejsze grupy mikroorganizmów glebowych. Ich...
Naukowcy umieścili glebowe drobnoustroje w łagodnym roztworze detergentu, dodali nietoksyczny barwnik wiążący się z DNA, a następnie wykorzystali sortowanie komórek aktywowane fluorescencyjnie (FACS) do izolowania pojedynczych komórek.
Gigantyczne wirusy, nawet setki razy większe od innych mają wyjątkowo duże genomy i są wychwytywane tą metodą ze względu na wielkość zbliżoną do bakterii (choć oczywiście w przypadku wirusów nie można mówić o komórkach).
Nowym gatunkom wirusów nadano nazwy "Dasovirus" od greckiego słowa daso oznaczającego las oraz "Solumvirus" - od łacińskiego określenia gleby. Proponowana jest też nazwa "Harvovirus" - na cześć Harvard Forest.
Odkryto na razie tylko DNA oraz białka otoczki, nie wiadomo zatem jeszcze, jak wyglądają - choć duże są na pewno. Zapewne wygląd wirusów poznamy w przyszłości. Aby się rozmnożyć wirus potrzebuje komórki - gospodarza. W przypadku znanych dotychczas wielkich wirusów zwykle jest nim jednokomórkowa ameba.
- Agrobiznes bez tajemnic. Zamów prenumeratę miesięcznika "Przedsiębiorca Rolny" już dziś
